ماموریت این سازمان بررسی‌های زمین شناسی و اکتشافی، شناسایی و پایش دارایی‌های معدنی کشور، منشاء‌یابی و پایش مخاطرات طبیعی؛ و تولید و انتشار داده‌های جامع و فراگیر علوم زمین مبتنی بر آمایش سرزمین و توسعه پایدار است.