مدیریت امور آزمایشگاه‌ها از سال 1345همزمان با سال‌های آغاز کار سازمان زمین شناسی به منظور تامین نیازهای این سازمان تاسیس شده است. این بخش به مرور و با توجه به پیشرفت جهانی فناوری آزمایشگاهی، تقویت و به روز رسانی شده و امروزه علاوه بر انجام خدمات آزمایشگاهی در حیطه وظایف حاکمیتی، به دیگر مراکز دولتی، خصوصی، دانشگاهی و تحقیقاتی نیز ارائه خدمات می‌دهد.

آزمایشگاه علوم زمین این سازمان که در کشور مرجع محسوب می­شود در راستای ارائه داده ­های ایمن، با صحت و دقت زیاد و در کوتاه ترین زمان ممکن گام برمی­ دارد. این بخش، با توجه به بهره‌مندی از تجربه کارشناسان خبره و ورزیده، آنالیز عنصری نمونه‌های گوناگونی مانند نمونه‌های خاک، گیاه، بافت جانوری و آب را به عهده می‌گیرد.

از جمله مهمترین اهداف و دستاورهای کلیدی که بر عهده این بخش می­باشد:

• جلوگیری از خروج ارز از کشور به واسطه انجام آنالیز نمونه­ های آزمایشگاهی زمین ­شناسی و اکتشافی
• حفظ و صیانت از داده­ ها و اطلاعات تولید شده حاصل از مختصات برداشتی و نتایج آنالیز نمونه­ های آن
• ظرفیت انجام آنالیز نزدیک به 110 هزار نمونه در سال با بهر­گیری از توان متخصصان و کارشناسان زبده

ضرورت و اهمیت برای جامعه و توسعه کشور:

با توجه به اینکه سازمان زمین­شناسی و اکتشافات معدنی کشور، رسالت اصلی خود را در زمینه تولید ثروت ملی، حفظ و نگهداری آن و  ایجاد اشتغال پایدار و توانمندسازی بخش خصوصی قرار داده است، از این رو انجام آنالیزهای آزمایشگاهی پشتیبان مطالعات زمین و اکتشافی در کشور و عملیات داده ­های حاصل از زمین و اکتشاف است. یکی از روش­های اعتبار سنجی و تکمیل چرخه زمین­ شناسی و اکتشاف محسوب می­شود.